На обновление помещений было направлено почти 47 миллионов рублей из регионального бюджета. Последний раз капитальный ремонт здесь проводили в начале 2000-х годов.
Каждый год в отделении получают медицинскую помощь около 800 пациентов. Специалисты занимаются диагностикой и лечением заболеваний желудочно-кишечного тракта, печени, желчных протоков и поджелудочной железы.
На третьем этаже одного из корпусов больницы на улице Лечебной была проведена полная модернизация: заменены окна, двери, отделаны стены, установлено новое напольное покрытие, обновлены инженерные коммуникации, электрические сети, противопожарная система и сигнализация в палатах. Также заменена крыша здания. После установки новой мебели, пациенты и медицинский персонал вернутся в отремонтированное помещение. Пока же они временно находятся на первом этаже.
Во время посещения больницы министр здравоохранения области Николай Гонтюрёв посетил палаты, пообщался с пациентами и узнал их мнение о качестве оказываемых медицинских услуг. Пациенты отметили наличие необходимых лекарственных препаратов, назначенных врачами. В приемном отделении министр ознакомился с работой медицинской информационной системы, используемой для ведения электронных карт пациентов.
Было дано поручение руководству больницы подготовить проектно-сметную документацию для проведения ремонтных работ во всем корпусе, включая фасад. В будущем здесь планируют открыть Региональный эндокринологический центр.
На данный момент продолжается ремонт четвертого этажа гинекологического корпуса на Пошехонском шоссе, где разместятся операционный блок и отделение гинекологии. В общей сложности в 2025 году на проведение капитальных ремонтов в отделениях Вологодской областной клинической больницы заложено 237 миллионов рублей. Согласно распоряжению губернатора Вологодской области Георгия Филимонова, в течение 2025 года на территории региона будет отремонтировано 103 объекта здравоохранения.