Аспирантка факультета фундаментальной медицины МГУ, автор курса «Методы машинного обучения для обработки биологических и медицинских изображений» в рамках конкурса для авторов курсов и факультативов фонда «Интеллект» Елизавета Чечехина выступила на международной конференции и представила уникальный ИИ инструмент – scParadise.
Конференция ASCA MOSCOW 2024 «Анализ отдельных клеток» посвящена современным методам анализа одиночных клеток, которые имеют важное значение для исследований в области биологии и медицины. На мероприятии были представлены лекции и доклады ведущих специалистов из России и зарубежья.
ASCA — это активно растущее международное сообщество исследователей, развивающих передовые методы современной биологии и медицины. ASCA продвигает новые технологии, такие как, например, секвенирование одиночных клеток, пространственная транскриптомика и нанопоровое секвенирование, что открывает новые возможности для изучения клеточной гетерогенности и функциональных характеристик клеток. Данные методы позволяют глубоко изучать особенности развития, функционирования и нарушения работы органов и тканей, а также открывают новые пути к пониманию механизмов развития заболеваний.
Елизавета Чечехина выступила с докладом о scParadise - ее уникальном ИИ инструменте. Он позволяет осуществлять многоуровневую автоматическую аннотацию клеточных типов, а также предсказывать представленность поверхностных белков на данных секвенирования одиночных клеток.
Инструмент представлен в открытом доступе в виде пакета для работы на языках программирования Python и R, а также опубликован в виде препринта на bioRxiv.
Конференции, которые организует ASCA, способствуют формированию профессионального сообщества, объединяющего ученых из разных стран, что позволяет расширять горизонты сотрудничества и обмена знаниями в этой быстро развивающейся области.