В логотипе ПГУПС буква «У» обозначает «Университет», а её графическое изображение — специфику нашего отраслевого вуза, то есть развитие, соединение и разветвление путей сообщения.
«1809» — год основания Университета.
Символы корпоративного знака — топор и якорь — заимствованы с эмблемы 1830 года Управления сухопутных и водных путей сообщения, что подчеркивает преемственность традиций транспортников XIX-XXI веков.
Книга — символ учения и знаний, передаваемых от поколения к поколению.
Знак имеет форму круга, олицетворяющего колесо, одно из самых гениальных изобретений человечества в области транспорта.