Как сообщает Северное УГМС, первоначально она располагалась в непосредственной близости от высокой деревянной церкви и водоема. Такое местоположение было не характерным для окружающей местности, поэтому в 1952 году станция была перенесена на северную окраину города на открытое место, где и находится в настоящее время.
В первое время метеорологические наблюдения на станции проводились в четыре срока над основными метеорологическими характеристиками. В дальнейшем сроки и программы наблюдений расширились, увеличился и штат сотрудников.
В первые годы М-2 Няндома была обеспечена необходимыми приборами и оборудованием: ртутным чашечным барометром, психрометрической будкой, дождемером с защитой Нифера и флюгером Вильда. Со временем парк приборов обновлялся и увеличивался. В ходе реализации Проекта по модернизации наблюдательной сети Росгидромета в 2012 году на М-2 Няндома установлен автоматизированный метеорологический комплекс (АМК). Станция оснащена сотовой связью и интернетом.
Сейчас М-2 Няндома входит в состав основной сети наблюдений Росгидромета, производит метеорологические и агрометеорологические наблюдения, проводит мониторинг загрязнений окружающей среды. Материалы наблюдений публикуются в климатических справочниках, ежегодниках и ежемесячниках. Оперативная информация станции используется синоптиками для составления прогнозов, при обслуживании различных отраслей экономики.