Лилия Васильевна Щур-Труханович в 2001 году окончила Московский открытый социальный университет по специальности «юриспруденция».
В 2012 году окончила магистратуру по специальности «юриспруденция» («международное право и право Европейского союза») в Российском государственном торгово-экономическом университете, а 2016 году – магистратуру МГИМО МИД России по специальности «международные отношения».
Кандидат экономических наук.
В 1995 – 2000 годах работала в организациях коммерческого сектора.
В 2001 – 2008 годах работала в консалтинговых, издательских, научно-исследовательских организациях в должностях эксперта, главного редактора, старшего научного работника.
В 2008 – 2009 годах – заместитель директора Департамента регулирования внутренней торговли Минпромторга России.
В 2010 – 2012 годах – директор АНО «Центр исследований в сфере экономики и права».
В 2012 – 2016 годах – заместитель директора Правового департамента Евразийской экономической комиссии.
В 2016 – 2017 годах – руководитель проектов в Департаменте национальной технологической инициативы Агентства стратегических инициатив, директор Департамента правовой экспертизы и нормотворческой работы Российской венчурной компании.
В 2017 – 2024 годах – заместитель директора Департамента развития и регулирования внешнеэкономической деятельности Минэкономразвития России, директор Департамента развития и регулирования внешнеэкономической деятельности Минэкономразвития России.
С 12 ноября 2024 года назначена директором Правового департамента Евразийской экономической комиссии.