Ученый Передовой инженерной школы «Агробиотек» Томского государственного университета, PhD Амджад Мухаммад Наваз проанализировал развитие и описал особенности биоинформатики в России. Егостатья опубликованав одном из самых престижных изданий в этой отрасли — Briefings in Bioinformatics, Oxford Academic (Q1).
Биоинформатика — наука на стыке программирования и геномики, которая начала активно развиваться в последние годы благодаря технологическому развитию. Ученые с помощью секвенирования ДНК определяют последовательность аминокислот в генах и кодируют эту информацию. Затем благодаря математическим алгоритмам биоинформатики могут быстро и точно прогнозировать результаты селекции или реакцию организма на новые лекарства, определять причины мутаций в генах и многое другое, что было недоступно еще 30 лет назад. За время существования науки о биологических данных наработано около секстилиона байт информации, за год сейчас производится около 2–4 квинтиллионов байт.
В своей работеАмджад Навазотмечает, что отличительные особенности биоинформатики в России — это активное развитие нового программного обеспечения для обработки биологических данных. Также отечественные ученые стремятся использовать в своих исследованиях высокие вычислительные мощности. Например, в Суперкомпьютерном центре ТГУ, где выполняется100 триллионов операций в секундуи оперативная память составляет 18 терабайт. Кроме того, российские биоинформатики реализуют масштабные проекты секвенирования, такие как секвенирование 100 000 геномов человека Сколковским институтом науки и технологий.
— Сегодня биоинформатика в России еще не устоялась как самостоятельная дисциплина, — говоритАмджад Наваз. — Поэтому необходимо продлевать такие инициативы, как Федеральную научно-техническую программа развития генетических технологий, с 2030 до 2050 года, а также создавать новые проекты. Например, национальную базу данных геномов, инструментов анализа и алгоритмов, чтобы можно было отслеживать прогресс страны в области биоинформатики.
Ученый ПИШ «Агробиотек» ТГУ Амджад Мухаммад Наваз
Фото: ПИШ ТГУ
Ученый считает, что в нашей стране ИТ, фармацевтика, биотехнология и сельское хозяйство являются движущими силами для развития биоинформатики. Например, ИТ-рынок в России в долларовом выражении растет быстрее мирового (12% против 5 %), и к 2030 году по прогнозам может достигнуть 7 трлн рублей. Фармацевтическое производство в РФ является одной из приоритетных отраслей, эффективность производства сельского хозяйства выше, чем промышленного, а сектор биотехнологий за последние 10 лет вырос более чем на 30%. Все эти факторы помогают науке о биологических данных в России, несмотря на более поздний старт, чем за рубежом, развиваться быстрыми темпами. Так, сегодня в России существует не менее 198 проектов по биоинформатике, получивших гранты Российского научного фонда.
— Я учился в Пакистане и получил степень PhD в Южной Корее, но приехал работать и преподавать биоинформатику в Россию, потому что здесь есть большие перспективы для изучения геномов сельскохозяйственных растений, — объясняетАмджад Мухаммад Наваз. — Сегодня биоинформатик может зарабатывать здесь от 60 000 до 200 000 рублей и может получить эту профессию бесплатно, например, вПИШ «Агробиотек» ТГУ.
Амджад Навазуже около двух лет работает старшим научным сотрудником и профессором в Передовой инженерной школе «Агробиотек» ТГУ в Томске. Он преподает омику, биоинформатику и программирование биологических данных не только в ТГУ, но и в Воронежском государственном агрономическом университете, старейшем агрономическом вузе страны, в рамках сетевого взаимодействия между университетами. Ранее ученый работал в Фейсалабадском сельскохозяйственном университете (Пакистан), Университете Болу Абант Иззет Байсал (Турция), Чоннамском национальном университете и Национальном университете Кёнсан (Южная Корея) и Дальневосточном федеральном университете. Опубликовал более 80 научных статей и глав книг по геномике растений, которые получили около 3 000 цитирований.
Его статья о развитии биоинформатики в России опубликована в журнале Briefings in Bioinformatics — одном из лучших изданий по теме биологических данных в мире. Издательство журнала — Oxford University Press — это платформа лондонского университета, которая включает более 500 журналов и 50 000 книг.
Ознакомиться с полным текстом работыможно по ссылке.
Ранее ПИШ «Агробиотек» ТГУ записалвидеоподкаст «Как накормить девять миллиардов?»с участиемАмджада Наваза.
Справка:ПИШ «Агробиотек» ТГУсоздана в 2022 году в партнерстве с высокотехнологичными компаниями и научно-образовательными организациями. Основные направления деятельности школы: фронтирные задачи агробиотехнологии, технологии повышения продуктивности агропроизводств, разработка питания будущего, улучшение пород и сортов, глубокая переработка продукции и отходов, внедрение технологий ИИ и цифровых технологий.