21 октября 2024 года в связи с истечением срока контракта А.В.Яковенко завершил свою работу в качестве Ректора Дипломатической академии МИД России.
Выступая на отчетно-выборном собрании коллектива 14 октября, А.В.Яковенко тепло поблагодарил коллег за совместную работу по развитию Академии, расширению ее возможностей по подготовке российских послов и повышению квалификации российских иностранных дипломатов. Работа коллектива в год 90-летия Академии была высоко отмечена благодарностью Президента России В.В.Путина.