В соответствии с приказом Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека от 01.12.2017 г. № 1116 «О совершенствовании системы мониторинга, лабораторной диагностики инфекционных и паразитарных болезней и индикации ПБА в Российской Федерации» на базе ФБУН «Тюменский научно-исследовательский институт краевой инфекционной патологии» Роспотребнадзора создан Научно-методический центр по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней II-IVгрупп патогенности по Тюменской области, Ханты-Мансийскому и Ямало-Ненецкому автономным округам. В 2022 году Научно-методический центр продолжил свою работу в соответствии с поставленными целями и задачами.

Основные задачи Научно-методического центра по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней II-IVгрупп патогенности

на 2022 год

1. Анализ данных официальной статистики, подготовка электронной базы.

2. Оказание консультативно-методической помощи в плановом порядке и по эпидемическим показаниям органам и организациям Роспотребнадзора в Тюменской области, Ханты-Мансийском автономном округе, Ямало-Ненецком автономном округе, организациям здравоохранения.

3. Внедрение новых методов и средств лабораторной диагностики инфекционных и паразитарных болезней в практику лабораторной службы Тюменской области, Ханты-Мансийского автономного округа, Ямало-Ненецкого автономного округа.

4. Участие в оценке санитарно-эпидемиологической обстановки

5. Формирование прогнозов инфекционной заболеваемости

6. Реализация научно-исследовательских работ с вовлечением специалистов органов и организаций Роспотребнадзора, медицинских организаций Тюменской области, ХМАО-Югры и ЯНАО

8. Подготовка предложений по совершенствованию лабораторной диагностики, мониторинга и эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными болезнями в субъектах РФ

9. Подготовка нормативно-методических документов.

10. Сотрудничество со средствами массовой информациии, публикация нформационных материалов

11. Подготовка публикаций.

В рамках взаимодействия в 2022 году продолжена работа по заключенным 3-х сторонним Соглашениям о взаимодействии и координации деятельности Научно-методического центра по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней II-IVгрупп патогенности, созданного на базе ФБУН ТНИИКИП Роспотребнадзора с Управлениями Роспотребнадзора и Центрами гигиены и эпидемиологии в Тюменской области, ХМАО-Югре и ЯНАО.

В рамках действующих соглашений о взаимодействии проводится сотрудничество в научно-практической деятельности, направленной на обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия населения по вопросам эпидемиологической диагностики и совершенствования системы эпидемиологического надзора за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней II-IVгрупп патогенности, в том числе в оказании консультативно-методической помощи по вопросам эпидемиологии, профилактики и диагностики инфекционных и паразитарных болезней, в совместном проведении научно-исследовательских работ, научно-практических конференций и семинаров, повышении профессиональной подготовки специалистов.

1. С целью проведения полного и качественного анализа, в рамках взаимодействия проводится сбор данных официальной статистики по направлениям:

- Форма № 2 СВЕДЕНИЯ ОБ ИНФЕКЦИОННЫХ И ПАРАЗИТАРНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЯХ (годовая отчетная форма, все разделы)

- Форма № 5 СВЕДЕНИЯ О ПРОФИЛАКТИЧЕСКИХ ПРИВИВКАХ (годовая отчетная форма, все разделы)

- Форма № 6 сведения О КОНТИНГЕНТАХ Детей и взрослых, ПРИВИТЫХ ПРОТИВ ИНФЕКЦИОННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ (годовая отчетная форма, все разделы)

- Форма № 23-21 сведения О ВСПЫШКАХ ИНФЕКЦИОННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ (годовая отчетная форма, все разделы)

- Форма № 1 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях» (годовая)

- Форма № 18 СВЕДЕНИЯ О САНИТАРНОМ СОСТОЯНИИ СУБЪЕКТА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ (годовая, разделы по инфекционной и паразитарной заболеваемости, ИСМП)

- Форма № 27 СВЕДЕНИЯ О ДЕЗИНФЕКЦИОННОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ (годовая, разделы по инфекционной и паразитарной заболеваемости, ИСМП)

- Форма № 2-18 «Сведения о деятельности лабораторий санитарно-гигиенического, микробиологического и паразитологического профиля федеральных бюджетных учреждений здравоохранения – центров гигиены и эпидемиологии» (годовая, разделы по инфекционной и паразитарной заболеваемости, ИСМП)

- Форма № 1 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях» (ежемесячная)

Информация обрабатывается с использованием программного комплекса SPSS.

Подготовлен Бюллетень по результатам мониторинга и анализа данных официальной статистики по заболеваемости и результатам деятельности лабораторий организаций Роспотребнадзора с определением административных территорий, требующих коррекции проблем в лабораторной диагностике, и выдачей рекомендаций за 2021 год

В 2022 году получено свидетельство о государственной регистрации Базы данных «Инфекции, передаваемые клещами, на территории Российской Федерации» за 2020-2021 г. (Свидетельство о государственной регистрации Федеральной службой по интеллектуальной собственности № 2022621894 от 10.08.2022 Рег. № РИД в ЕГИСУ НИОКТР 622100300177-7 Дата регистрации 03.10.2022 г.)

2. В 2022 году оказывалась консультационная помощь по диагностике сложных случаев инфекционных и паразитарных заболеваний с неясной этиологией по направлениям медицинских организаций и органов Роспотребнадзора курируемых субъектов:

Проведено консультирование по диагностике сложных случаев инфекционных и паразитарных заболеваний с неясной этиологией по направлениям медицинских организаций и органов Роспотребнадзора курируемых субъектов: Проведено лечение 361 и консультирование 24430 пациентов по направлениям учреждений Роспотребнадзора и медицинских организаций из различных субъектов РФ.

Проводилась идентификация возбудителей инфекционных и паразитарных болезней, участие в расшифровке вспышек по запросам органов и организаций Роспотребнадзора, организаций здравоохранения:

1) Еженедельно в Роспотребнадзор представляется сводный отчет «Эпидемиологическая ситуация по COVID-19 в Тюменской области, Ханты-Мансийском и Ямало-Ненецком АО» с краткосрочным прогнозом эпидситуации по каждой территории (всего 52 отчета).

- Еженедельные отчеты «Эпидемиологическая ситуация по COVID-19» отправляются в Управления Роспотребнадзора по Тюменской области, Ханты-Мансийскому автономному округу-Югре, Ямало-Ненецкому автономному округу» (всего 156 отчетов).

- Еженедельно в ФБУН «ЦНИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора направляются отчеты «Эпидемиологическая ситуация по COVID-19 в субъектах УрФО, результаты молекулярно-генетического мониторинга изолятов SARS-COV-2, выполненного на базе лаборатории молекулярно-генетических исследований ФБУН ТНИИКИП Роспотребнадзора». (всего 63 отчета)

- Еженедельно в Департамент здравоохранения Тюменской области представляется отчет «Эпидемиологическая ситуация по внебольничным пневмониям, острым респираторным инфекциям, COVID-19 в Тюменской области» (всего 52 отчета)

2) ФБУН ТНИИКИП Роспотребнадзора проводит фрагментное секвенирование возбудителя новой коронавирусной инфекции с января 2021 года. За 2022 год проведено 2530 исследований образцов, поступивших из субъектов УрФО.

3) На базе института проведено более 10000 исследований по ПЦР-диагностике для Тюменской области.

4) С целью установления причины заболевания (возбудителя) при госпитализации в медицинскую организацию граждан с подозрением на пневмонию или с подтвержденной пневмонией, ФБУН ТНИИКИП Роспотребнадзора с 16.04.2020 организовал получение от медицинских организаций проб биоматериала и проводит их лабораторное исследование методом ПЦР и бактериологическими методами с применением масс-спектрометрии. Проводятся ПЦР-исследования на вирусы гриппа, респираторно-синцитиальный вирус, вирусы парагриппа, риновирусы, аденовирусы, человеческие метапневмовирусы, MERS-CoV, Legionella pneumophila, микобактерии туберкулеза, Bordetella spp., Listeria monocytogenes, Brucella spp., Mycoplasma pneumoniae и Chlamydophila pneumoniae, а также микробиологическая диагностика на Streptococcus pneumoniae, а также иные возбудители бактериальных респираторных инфекций нижних дыхательных путей. Исследованы образцы от 463 человек.

5) По запросу ФБУЗ «ЦГиЭ в Тюменской области» и ФБУЗ «ЦГиЭ в ХМАО-Югре» в препаратах крови проведено 14 исследований по идентификации возбудителя малярии.

В 2022 проводилось консультирование многопрофильных больниц и органов Роспотребнадзора Тюменской области по результатам изучения состава и антибиотикорезистентности циркулирующей среди пациентов стационара условно-патогенной микрофлоры: ГАУЗ ТО «Перинатальный центр»; ГАУЗ ТО Многопрофильный клинический медицинский центр «Медицинский город»; ГБУЗ ТО ОБ №13 (с. Исетское)

Проводится изучение лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза пациентов Тюменского областного противотуберкулезного диспансера с целью назначения адекватной терапии: выявление мутаций, обеспечивающих резистентность к антибиотикам второго ряда, в клиническом материале методом ПЦР. Осуществляется идентификация штаммов нетуберкулезных микобактерий методом ДНК-гибридизации.

Принято участие в расшифровке этиологии вспышек инфекционных и паразитарных болезней по запросам органов и организаций Роспотребнадзора.

В целях оказания качественной и доступной медицинской помощи мобильная врачебная бригада с участием К.Б.Степановой – главного внештатного специалиста по инфекционным болезням ДЗ ТО по поручению ДЗ ТО проводила внешний аудит организации и качества оказания медицинской помощи в моногоспиталях и поликлиниках Тюменской области (оказывали методическую и консультативную лечебно-диагностическую помощь)

Подготовлены экспертные справки для организаций здравоохранения по вопросам заболеваемости, диагностики, лечения и профилактики COVID-19.

Проведены семинары для ЛПУ по данным вопросам.

3. С целью внедрения новых методов и средств лабораторной диагностики инфекционных и паразитарных болезней в практику лабораторной службы Тюменской области, ХМАО-Югры и ЯНАО проведено:

- Обучение новым подходам к расшифровке вспышек с применением масс-спектрометрии, прибора Сенсититр для определения антибиотикочувствительности; комплекса молекулярно-диагностических методов

- Консультации для сотрудников лабораторий медицинских организаций по основам ПЦР-диагностики, фрагментного секвенирования

4. Участие в оценке санитарно-эпидемиологической обстановки

Проводились плановые экспедиционные выезды в природный и антропургический очаги клещевых инфекций (стационар многолетних наблюдений в Нижне-Тавдинском районе, стационарные точки г.Тюмень), исследовано на природно-очаговые инфекции 626 иксодовых клещей. По результатам лабораторного анализа в 52,6 ± 5,07 % выявлена ДНК боррелий комплекса B. Burgdorferi sensu lato, в 6,2 ± 2,4 % моноцитарный эрлихиоз человека, в 17,5 ± 3,9 % гранулоцитарный анаплазмоз человека.

Основным видом иксодового клеща, принимаемого от обратившегося населения, является клещ таежный. Из 97 исследованных иксодовых клещей, носителями возбудителей «клещевых инфекций», оказались 33, что составляет 34,02± 4,8%. Из общего количества исследованных таежных и луговых клещей основной процент инфекций приходится на боррелии: 25,8±4,4%. Встречается микст-носительство, наиболее часто: эрлихии/боррелии - 4,12± 2,01%; бореллии/ вирус клещевого энцефалита — 3,09±1,75%.

В рамках сотрудничества по научно-практической деятельности по вопросам эпидемиологической диагностики и совершенствования системы эпидемиологического надзора за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней II-IVгрупп патогенности, как основной задаче Научно-методического центра к.м.н. в.н.с. зав. клиникой Степанова К.Б. приняла участие в региональном совещании «Совершенствование эпидемиологического надзора за корью, краснухой и эпидемическим паротитом в Российской Федерации» (29-30.11.2022 г. Томск)

5. В рамках формирования прогнозов инфекционной заболеваемости в 2022 году

Подготовлен отчет о НИР «Обзор и прогноз состояния популяций и численности мелких млекопитающих и членистоногих – носителей и переносчиков возбудителей природно-очаговых болезней на территории Западной Сибири» и направлен в ФБУЗ ФЦГиЭ для использования данных при подготовке ИМП

Подготовлен краткосрочный прогноз эпидемической ситуации по новой коронавирусной инфекции еженедельно в тексте отчета «Эпидемиологическая ситуация по COVID-19 в Тюменской области, Ханты-Мансийском и Ямало-Ненецком АО» (всего 156 отчетов) представляется в Федеральную службу и в территориальные органы Роспотребнадзора.

Реализуются НИР по:

· совершенствованию методов эпидемиологического надзора за паразитарными болезнями

· разработке и оценке эффективности систем мониторинга биологической безопасности в стационарах Тюменской области различного профиля;

· анализу состава и антибиотикорезистентности микробиоты пациентов многопрофильных стационаров;

· анализу эпидемического процесса новой коронавирусной инфекции

Сформированы рабочие коллекции штаммов, выделенных из клинического материала и объектов окружающей среды

Подготовлены совместные публикации по результатам совместной реализации НИР:

- Степанова Т.Ф., Крига А.С., Беляева М.И., Михайлова О.А., Кошкарев Р.В., Кротов С.А. Оценка состояния и тенденций эпидемического процесса описторхоза в отдельных районах Омской области // Важнейшие вопросы инфекционных и паразитарных болезней. Десятый сборник научных работ. Тюмень: ООО «Печатник», 2022. С.169-174.

- Беляева М.И., Степанова Т.Ф., Григорьев О.В., Кротов С.А., Скотников А.Л. Видовое разнообразие и зараженность моллюсков семейства Bithyniidae личинками трематод сем. Opisthorchidae в Омской области // Важнейшие вопросы инфекционных и паразитарных болезней. Десятый сборник научных работ. Тюмень: ООО «Печатник», 2022. С34-37.

- Акимкин В.Г., Попова А.Ю., Хафизов К.Ф., и др. COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение II: динамика циркуляции геновариантов вируса SARS-CoV-2 // Журнал микробиологии, Эпидемиологии и иммунобиологии. 2022. Том 99, № 4. С.381-396

7. Повышение профессиональной подготовки специалистов органов и организаций Роспотребнадзора, медицинских организаций Тюменской области, ХМАО-Югры и ЯНАО в рамках образовательной деятельности по программам дополнительного профессионального образования в соответствии с лицензией на осуществление образовательной деятельности № 024 от 20.03.2017 г., выданной Департаментом образования и науки Тюменской области

Проведены курсы повышения квалификации и профессиональной переподготовки по программам дополнительного профессионального образования в соответствии с лицензией с выдачей документов установленного образца для 15 специалистов Роспотребнадзора и мед.организаций: бактериология (3), санитарная бактериология (1), лабораторное дело в бактериологии (4), клиническая лабораторная диагностика для биологов (6), лабораторная диагностика паразитарных болезней (1)

В 2022году с целью повышения уровня знаний врачей и специалистов органов Роспотребнадзора и учреждений здравоохранения по вопросам диагностики, лечения и профилактики паразитарных болезней сделано 29 докладов и лекций

Прочитаны лекции по темам: «Диагностика, лечение и профилактика кишечных инфекций и паразитозов», «Вопросы диагностики, лечения и профилактики паразитарных заболеваний» и др.

В 2022 году подготовлен Бюллетень по результатам мониторинга и анализа данных официальной статистики по заболеваемости и результатам деятельности лабораторий организаций Роспотребнадзора с определением административных территорий, требующих коррекции проблем в лабораторной диагностике, и выдачей рекомендаций за 2021 год

9. Подготовлены нормативные документы, предложения в МУ, проекты документов:

· Свод предложений и проект изменений в главу XLIII СанПиН 3.3686-21 «Санитарно-эпидемиологические требования по профилактике инфекционных болезней» («Профилактика паразитарных болезней на территории Российской Федерации»)

· Проект МУК «Методы лабораторных исследований объектов окружающей среды и биологических субстратов человека на наличие ооцист криптоспоридий»

· Проект МУК 4.2.2661-10 «Методы санитарно-паразитологических исследований»

· Проект пересмотра МУ «Эпидемиологический надзор за токсокарозом»

· Проект пересмотра МУ «Профилактика лямблиоза»

· Проект МУ «Профилактика педикулеза»

· Проект МУ «Профилактика чесотки»

Утверждены 02.12.2022г. МУК 3.2.3804-22 «Методы санитарно-паразитологической экспертизы рыбы, моллюсков, ракообразных, земноводных, пресмыкающихся и продуктов их переработки»

10. В рамках реализации задачи «Сотрудничество со средствами массовой информациии, публикация нформационных материалов» освещаются основные результаты научно-исследовательской работы, экспедиционных выездов на официальном сайте ФБУН «Тюменский научно-исследовательский институт краевой инфекционной патологии» Роспотребнадзора.

Большая работа проводится по профилактике паразитарных заболеваний для населения. В 2022 году организованы и проведены интервью на телевидении и Интернет порталах по актуальным вопросам (7 интервью).

Специалисты Референс-центра принимали участие в обучающих мероприятиях регионального уровня, на которых представляли информацию по диагностике, лечению и профилактике инфекционных и паразитраных заболеваний. Принято участие в 10 мероприятиях, представлено 10 докладов

11. В 2022 году проводилась активная публикационная работа, в т.ч. в соавторстве с практиками. Подготовлено 93 публикации, в т.ч. индексируемых в Web of Science — 6, Scopus — 11, РИНЦ — 86.

Издана Монография - Степанова Т.Ф., Якина Н.Х., Катин А.А., Леонтьева С.А. «Прогнозирование зараженности Ixodes Persulcatus возбудителем клещевого энцефалита на основе изучения особенностей возрастной гетерогенности их популяции вольерным способом». — Монография / колл. авт. — Тюмень: ООО «Печатник», 2022. — 120 с. ISBN 978-5-4266-0210-6 Тираж 300 экз.

По итогам проведенного анализа подготовлены следующие документы:

1. Научный отчет «Определение литической активности фагосодержащих лекарственных препаратов и генов антибиотикорезистентности штаммов, изолированных от окончательных, промежуточных хозяев и из мест их обитания»

2. Научный отчет «Характеристика возбудителей ИСМП, циркулирующих в учреждениях родовспоможения выявление особенностей фаго- и антибиотикорезистентности штаммов»

3. Научный отчет «Роль гамазовых клещей в циркуляции природно-очаговых инфекций на территории Западной Сибири»

4. Научный отчет «Обзор и прогноз состояния популяций и численности мелких млекопитающих и членистоногих – носителей и переносчиков возбудителей природно-очаговых болезней в Западной Сибири»

5. Научный отчет «Региональные особенности эпидемического процесса описторхоза в антропургических очагах»

6. Научный отчет «Разработка системы эпидемиологической безопасности в многопрофильной медицинской организации СРВ»

7. Научный отчет «Санитарно-бактериологическая оценка качества водных объектов и пищевой продукции из рыбы и беспозвоночных СРВ»

8. База данных «Инфекции, передаваемые клещами, на территории Российской Федерации» за 2020-2021 г. (Свидетельство о государственной регистрации Федеральной службой по интеллектуальной собственности № 2022621894 от 10.08.2022 Рег. № РИД в ЕГИСУ НИОКТР 622100300177-7 Дата регистрации 03.10.2022 г.)