29 ИЮН, 12:11
Ученые Института цитологии и генетики СО РАН планируют к концу 2020 года создать программную платформу, которая позволит сократить время работы с отдельным геномом
НОВОСИБИРСК, 29 июня. /ТАСС/. Ученые Института цитологии и генетики (ИЦиГ) СО РАН в рамках работы Курчатовского геномного центра мирового уровня создадут библиотеку геномов 10 тыс. микроорганизмов. Создание такой библиотеки позволит увеличить эффективность выработки полезных веществ данными микроорганизмами, говорится в сообщении пресс-службы ИЦиГ СО РАН.
ИЦиГ СО РАН вошел в число участников консорциума по созданию геномных центров, головной организацией консорциума является Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (НИЦ КИ). Создание научных центров мирового уровня предусмотрено национальным проектом "Наука".
"Исследования в этой области [биоинформатики] составляют существенную часть научной работы, проводимой в рамках Курчатовского геномного центра мирового уровня, в число организаторов которого входит ФИЦ ИЦиГ СО РАН. Один из ключевых проектов - создание библиотеки моделей геномов на основе коллекций микроорганизмов, которыми располагают научные институты нашей страны", - говорится в сообщении.
Микроорганизмы, которые изучают ученые, могут использоваться в синтезе сырья для фармакологической промышленности, для ликвидации загрязнения окружающей среды нефтепродуктами, в процессах переработки мусора и других сферах. Отмечается, что в рамках данной работы проходит процесс секвенирования их геномов. После этого на основе геномной информации выстраивается метаболическая карта организма, которая информирует о том какие биохимические реакции в нем могут протекать. Вместе с этим ученые составляют карты генетической регуляции, показывающие как взаимодействуют между собой гены.
Таким образом, в итоге ученые получают данные о том как конкретные микроорганизмы синтезируют ценные продукты, а также каким образом можно увеличить получение такого продукта. Например, ученые планируют проводить отбор микроорганизмов, которые синтезируют органические кислоты, востребованные в производстве кормов для сельского хозяйства. Для этой цели биоинформатики отобрали 17 перспективных бактерий, которые теперь будут изучены более детально.
Отмечается, что всего ученым предстоит изучить порядка 10 тыс. микроорганизмов. При этом работа над одним геномом требует у исследователей от полугода до года работы. В связи с этим ученые работают над автоматизацией процесса. Ученые рассчитывают к концу текущего года создать программную платформу, которая позволит сократить время работы с отдельным геномом.