Чернышов родился в Твери, окончил Санкт-Петербургскую государственную академию театрального искусства по специальности "режиссер". Ставил спектакли в БДТ им. Г. Товстоногова, театре "Балтийский дом", Екатеринбургском театре юного зрителя и многих других. Работы Чернышова номинировались на премии "Золотая маска", "Прорыв", "Реальный дебют".
В Кирове Егор Чернышов участвовал в режиссерских лабораториях с эскизами по пьесам "Ночь и туман" и "Красный волк", а также ставил спектакли "Каренин" и "Дуэль" в "Театре на Спасской".